自然人憑證是可以在網路上作資料交換時，如同網路身分證辨識雙方身分，原理是採用了一種叫「憑證」的工具。「憑證」包含了「數位簽章」跟「公開金鑰」。這個公開金鑰是智慧型的IC卡自己演算出來的一組金鑰對中的一半，另一半稱為「私密金鑰」，則永遠儲存在IC晶片當中，經由憑證使用人和憑證管理中心約定，日後用這憑證，身分就可以辨認，啟用了加解密的功能，不管你在網路上傳什麼資料，資料都被加密，駭客攔截了資料也無法輕易的解開。
自然人憑證不僅僅是憑證，他是由內政部憑證管理中心所簽發的，降低了個人資料外洩的危險，目前本行可應用於Bank 3.0數位銀行專區之數位存款帳戶、隨行保鑣等相關申辦。